航海(空)系开设航海类专业2个：航海技术和轮机工程技术；港口类专业2个：港口机械与智能控制和港口与航运管理；航空类专业3个；飞机机电设备维修、通用航空器维修和民航运输服务。航海类专业先后建成中央财政支持重点建设专业、安徽省特色专业、安徽省特色实训中心;航空类专业获得省发改委资助专项，投入资金1600万建设航空产教融合实训基地。

航海(空)系拥有一支政治素质过硬、业务精湛的教师队伍，现有教职工48人，双师型教师占比90%以上、硕士以上学历占比60%以上，具有海船适任证书教师占比90%以上，其中省部级人才入选者1人，省级教学名师1人，博士2人，副高级以上职称7人，甲类一等船长10人，甲类一等轮机长5人，具有民用航空器维修人员执照或相应机型执照7人。

系部拥有航海实训中心、轮机实训中心、港口机械实训中心、飞机发动机实训中心、飞机机电设备虚拟仿真实训室、飞机维修实训室、机场地面服务实训中心、空中乘务实训中心和多个校企合作实习实训基地。师资和场地、设施设备完全满足《海员培训、发证和值班标准(STCW 国际公约)》和《中华人民共和国船员培训管理规则》要求，获得国家海事局颁发的船员教育和培训许可证书和质量管理体系证书。